药物化学教研室成立于1999年，2012年起招收药物化学硕士研究生。目前，教研室有专职教师9人，均具有博士学位，其中，教授4人，副教授2人，讲师3人，具有海外访学/学习经历5人。教研室拥有江苏省特聘教授1人，江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人1人，江苏省“333”高层次人才第三层次培养对象1人，江苏省“六大人才高峰”高层次人才培养对象4人，江苏省“青蓝工程”优秀青年骨干教师1人；江苏省“双创计划”科技副总2人。
教研室依托江苏省新药研究与临床药学重点实验室，拥有完善的药物合成实验室、计算机辅助药物设计平台，包括核磁共振仪、微波反应合成仪、平行反应合成仪、质谱、气相色谱仪、全自动中高压分离系统、Dell计算服务器等。近年来，教研室先后获得国家自然科学基金9项，中国博士后基金2项，江苏省自然科学基金7项，江苏省博士后基金2项，江苏省高校自然科学基金2项，江苏省普通高校研究生科研创新计划项目5项，徐州市社会发展科技计划项目10余项，共发表SCI研究论文100余篇，最高影响因子为15.304。
教研室积极投身于教学教育与人才培养，取得了良好的教学效果。目前承担本科生《药物化学》、《药物设计》和《药学文献检索》的理论及教学任务，以及硕士研究生的《化员工物学研究与进展》教学任务。其中,《药物化学》课程先后被评为williamhill登录入口校级精品课程和思政示范课程；《化员工物学研究与进展》先后评为全国药学专业学位研究生精品课程、全国药学专业学位研究生在线示范课程和江苏省高校生物学学科联盟优秀研究生课程。近年来，教研室教师副主编教材2部，参编教材多部，发表教学论文10余篇，承担各级高等教育教改研究课题7项。获得全国高等学校药学类专业青年教师微课教学大赛二等奖1项、江苏省高校微课教学比赛三等奖1项、williamhill登录入口中青年教师讲课比赛二等奖和三等奖各1项、威廉公司官网中青年教师基本功比赛一等奖1项。指导员工获得全国老员工基础医学创新研究暨实验设计论坛总决赛铜奖1项、全国老员工生命科学竞赛一等奖和三等奖1项、“全国老员工药苑论坛”创新成果奖一等奖1项、江苏省老员工课外学术科技作品竞赛暨“挑战杯”全国竞赛江苏省选拔赛决赛二等奖1项、江苏省老员工生物医学工程创新设计竞赛三等奖1项，获批国家级老员工创新创业训练计划项目10余项。
